• esa unggul
  • kunjungan
  • kapusbiotek
  • apec2019a
  • dputiapec2019a
  • biotekastra-3 1
  • kerjasamabalitri
  • Kunjungan Universitas Esa Unggul Jurusan Bioteknologi ke Pusat Penelitian Bioteknologi-LIPI, Cibinong- 3 Desember 2019
  • Kunjungan SD Plus Cerdas Alam Rizkia ke Kebun Plasma Nutfah Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI, Cibinong,10 oktober 2019
  • Pelantikan Dr. Puspita Lisdiyanti M. Agr. Chem sebagai Kepala Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI dan Dr. Ahmad Fathoni sebagai Plt. Kabid Pengelolaan Penelitian Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI Periode 2019-2024 oleh kepala Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia di Jakarta, 10 September 2019.
  • Annual Meeting and Seminar 2019 : APEC Reserach Center for Advanced Biohydrogen Technology,July 26, 2019 at Ekakarya Botanical Garden, Bedugul, Bali
  • Deputy of Life Sciences at Annual Meeting and Seminar 2019 : APEC Reserach Center for Advanced Biohydrogen Technology,July 26, 2019 at Ekakarya Botanical Garden, Bedugul, Bali
  • Perkuat Kemitraan, LIPI Terima Kunjungan Sains PT Astra International, TBK.
  • Pusat Penelitian Bioteknologi Lipi Jalin Kerjasama Dengan Balai Penelitian Tanaman Industri Dan Penyegar Kementrian Pertanian

bioteknologi update a

seputar biotek web

biotek media

Print

ILE655VAL Genotyping Study of HER2 - Positive Breast Cancer of Patients from Padang - Indonesia With High Resolution Melting Technique

ILE655VAL Genotyping Study of HER2 - Positive Breast Cancer of Patients from Padang - Indonesia With High Resolution Melting Technique

Dwi Wulandari, Azamris Azamris, Isna Nurhayati, M Ali Warisman, Bugi Ratno Budiarto, Desriani Desriani

Annales Bogorienses Vol. 21, No. 2: 69-75

her2Trastuzumab has proven to be a great improvement in the treatment of HER2+ breast cancer patients, but it is associated with relevant adverse cardiac events and significantly elevated cost of treatment. One of the risk factor for cardiotoxicity due to trastuzumab is the I655V HER2 polymorphism (GTC> ATC mutation) in which the allele mutant (Ile/Val or Val/Val) has a higher risk than the wild type (Ile/Ile). The detection of specific alleles is very important for therapeutic decision-making. In this study, our group has developed a high resolution melting (HRM) with EvaGreen dye method to discriminate specific allele of I655V HER2 (wild type, heterozygote mutant or homozygote mutant) in 66 frozen section samples of HER2+ breast cancer patients. Our study revealed that the wild type is the most prevalent allele (77,27%), whereas heterozygous mutation is significantly present in this research (21.21%) and around 1.52% of samples were detected as minor allele. Only one sample was detected as a minor allele (Val/Val) and may have relatively low abundance in the population. This method has been compared to Sanger sequencing and shows 100% of validity.

Keywords: Breast cancer, HER2, I655V, HRM, allele

Katalog: http://http://jurnal.biotek.lipi.go.id/index.php/annales/article/view/310/pdf

Disusun oleh: Ludya AB/Pustakawan

Print

Improvement of HER2I655V TARMS-PCR Performance by DNA Quality Analysis

Improvement of HER2I655V TARMS-PCR Performance by DNA Quality Analysis

Bugi Ratno Budiarto, Azamris, and Desriani

Annales Bogorienses Vol. 21 (2): 52-62.

 tarmReliable TARMS-PCR is a prerequisite in constructing a solid conclusion in genetic diagnostics. The validity of data generated by this molecular technique in most cases is hampered by a false positive result. In attempt to develop a TARMS-PCR for HER2I655V genotyping with no interfering of bias we used DNase I to eliminate DNA contaminant resided in PCR reagent. TARMS-PCR with no enzymatic pretreatment on PCR master mix kit produced a false positive result on HER2I655V TARMS-PCR using as recombinant plasmids system model proven by the presence of multiple PCR products in Non-Template Control (NTC). A dose of 0.1 U of the enzyme could eliminate this DNA contaminant effectively, although this pretreatment altered the specificity of HER2I655V TARMS-PCR genotyping on certain genotype. Combination of touchdown TARMS-PCR with another allelespecific primer recovered specificity of detection on this model system. Interestingly, this optimized HER2I655V TARMS-PCR can only be used for genotyping the clinical samples if only further optimization was done using genomic DNA as template.

Keywords: TARMS-PCR, HER2I655V, DNase I, Polymorphism

Katalog: http://http://jurnal.biotek.lipi.go.id/index.php/annales/article/view/308/pdf

Disusun oleh: Ludya AB/Pustakawan

 

Video Bioteknologi LIPI


Profil Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI 

Lock full review www.8betting.co.uk 888 Bookmaker

Seputar Biotek

Mahasiswa Universitas Nasional Jakarta Kunjungi Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI

Cibinong-Humas LIPI. Pusat Penelitian Bioteknologi Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI) menjadi  salah satu objek dalam memperdalam bidang  ilmu hayati,  seperti halnya kali ini Fakultas Biologi Universitas Nasional Jakarta, mengadakan kunjungan ke Puslit Bioteknologi,  pada Senin (16/12) 2019. Rombongan yang terdiri dari dosen pendamping dan mahasiswa ini diterima di gedung Meat-Milk Pro Puslit Bioteknologi-LIPI oleh tim Humas Kawasan CSC-BG, Cibinong. Sebelum melakukan kegiatan, terlebih dahulu pengunjung mendapatkan informasi terkait kegiatan penelitian melalui tayangan video profil LIPI dan Pusat Penelitian Bioteknologi, agar pengunjung  mendapatkan informasi tentang kegiatan penelitian yang dilaksanakan oleh Puslit Bioteknologi di laboratorium.

Selanjutnya kegiatan dilanjutkan dengan kunjungan ke beberapa Laboratorium, mahasiswa dan pendamping yang berjumlah 20 orang di arahkan  untuk melihat langsung Laboratorium yang ada di Pusat Penelitian Bioteknologi-LIPI yaitu : Laboratorium Biokatalis dan Fermentasi serta Laboratorium Bioenergi dan Bioproses. Peserta kunjungan yang ke Lab Biokatalis dan Fermentasi di pandu Ade Andriani, mengutarakan bahwa tentang kegiatan pada Lab penelitian ini  dilakukan adalah  dengan memanfaatkan mikroba dan enzim melalui fermentasi/reaksi berbasis rekayasa genetika mikroba. Lanjut Ade, beberapa produk utama yang dihasilkan adalah Oligosakarida (pangan fungsional), enzim kasar dan enzim murni untuk kebutuhan industri pangan, farmasi dan energi, Penyediaan mikroba potensial untuk industri dan lingkungan serta Produk hasil fermentasi. Pada Lab Bioenergi dan Bioproses, Swastika menjelaskan tentang pengembangan bioenergi dari mikroba fotosintesa dan pengembangan total proses dari bioenergi (biorifenari dari bioenergi).

Kepada pengunjung disampaikan bahwa Pusat Penelitian Bioteknologi juga menawarkan beberapa program yang dapat diikuti oleh para mahasiswa yang berminat di bidang bioteknologi seperti mengikuti kegiatan pelatihan dan bimbingan mengingat Puslit  Bioteknologi memiliki 17 laboratorium dengan kompetensi inti yang berbeda-beda. (est/edt:ks)

Laporan

 laptah2018 

cover rb2017 

lkj2018

kunjungan

pelatihan

pembimbingan

pengujian

Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI