çadır

| Print |

gsx3Linda Sukmarini, Elvi Yetti

 

Latar belakang dan Permasalahan

Industri paper di Indonesia mengalami peningkatan yang tajam, dan telah menempati rangking 2 di dunia. Peningkatan produksi paper, dibarengi dengan peningkatan polusi akibat meningkatnya penggunaan klorine pada proses bleaching. Oleh karena itu diperlukan senyawa pengganti klorin yang lebih aman, dalam hal ini adalah enzim xylanase. Hanya saja, enzim xylanase yang dibutuhkan adalah enzim xylanase yang mampu aktif pada suhu tinggi dan pH basa.

Di sisi lain, penggunaan enzim xylanase pada industry kertas berdampak pada meningkatnya biaya produksi. Untuk menjawab tantangan tersebut di atas, gen xylanase xynA penyandi termostable xylanase telah diisolasi dari strain yang berasal dari pantai sekitar kawah gunung, Tanjung Api, Poso. Hasil analisis sekuensnya menunjukkan bahwa open reading frame (ORF) gen xynA sebesar 1221 bp menyandi 407 asam amino termasuk 30 residu signal peptida. Dalam rangka mengkaji potensi gen xynA penyandi enzim xylanase, dalam penelitian ini dilakukan studi bioinformatika, sub kloning ke vektor ekspresi, dan purifikasi enzim.

 

Tujuan dan Hipotesa

Tujuan penelitian ini adalah untuk memproduksi enzim rekombinan xylanase dari strain lokal G. stearothermophilus, yang diekspresikan pada Escherichia coli BL21 (DE3) dan untuk mengkarakterisasi suhu dan pH dari enzim rekombinan.

 

gsx1Metoda

Metoda yang digunakan terdiri dari studi bioinformatika yang terdiri dari alignment, prediksi struktur tiga dimensi enzim xylanase dengan menggunakan program MOE, subkloning, memasukkan gen xynA ke dalam vektor ekspresi, pET21b, dilanjutkan dengan proses transformasi ke dalam inang, yaitu E.coli DH5 dan E.coli BL21. Positif klon diisolasi dengan menggunakan teknik PCR colony, dan positif klon kemudian digunakan untuk proses ekspresi dan purifikasi.

Hasil yang diperoleh

Studi bioinformatika yang meliputi alignmen asam amino dari beberapa bacterial xylanase menunjukkan adanya tingkat homologi yang tinggi dengan xylanase thermostabil-alkalistabil dari G. stearothermophilus T-6 (98%) yang digolongkan sebagai glycoside hydrolase family 10 (GH10) (Khasin et al., 1993). Terdapat 5 perbedaan asam amino dengan xylanase dari Bacillus stearothermophilus T-6 (Gambar 1). Selain itu, Studi sekuen asam amino juga menunjukkan bahwa xylanase lokal memiliki kemiripan yang tinggi dengan Bacillus stearothermophilus T-6 (Tabel 1), sehingga diprediksi juga memiliki kemampuan yang sama, yaitu stabil pada pH 9 pada suhu 65°C. Dengan demikian, secara bioinformatika, enzim xylanase lokal memiliki potensi untuk digunakan dalam industry pulp.

Hasil yang diperolehHasil skrining dengan teknik PCR koloni, telah didapatkan plasmid pETxynA hasil ligasi gen xynA dengan vektor ekspresi yang diisolasi dari inang E.coli BL21 untuk mengekspresikan enzim rekombinan xylanase (gambar 2b). Purifikasi dengan menggunakan ion exchange chromatography. Tetapi karena dalam masa penyimpanan, plasmid tidak stabil, sehingga plasmid pETxynA sering hilang dari inangnya. Untuk saat ini, kami sedang mencoba menggunakan vektor ekspresi lain, yaitu pET 32b. PCR fragmen xynA untuk diinsersikan ke dalam pET32b telah kami dapatkan dan sekarang dalam proses insersi ke dalam pET32b dan transformasi ke E.coli DH5 dan E.coli BL21

Tabel 3. Studi bioinformatika terhadap sekuens asam amino dari protein xylanase

Gambar 2. A) Hasil purifikasi xynA dan pET21b. B) Hasil PCR koloni terhadap transforman

 

Gambar 3.Ekspresi enzim xylanase lokal (a) dan purifikasinya (b)

Manfaat Kegiatan

Enzim xylanase yang termostabil dan alkali stabil sangat cocok untuk diaplikasikan di industry kertas. Gen xynA yang kami isolasi memiliki kemiripan (homologi) yang tinggi dengan enzim xylanase dari B. stearothermophilus T-6, dengan karakter mampu aktif pada pH 9 dan suhu 65°C. Sehingga diprediksi enzim xylanase tersebut berpotensi untuk diaplikasikan di industry kertas.

Rekomendasi/ promosi teknologi yang dihasilkan

Karena karakterisasi enzim xylanase belum bisa dilakukan saat ini, rekomendasi promosi hasil belum bisa dilakukan. Hanya saja dari pendekatan bioinformatika, enzim ini sangat berpotensi dalam industry kertas.

 

 

 

gsx2xylanase

Bioresources LIPI Expo 2014

logoseminar-bioresources2014

VIDEO BIOTEKNOLOGI-LIPI



Get the Flash Player to see this player.

time2online Joomla Extensions: Simple Video Flash Player Module

Reformasi Birokrasi

Bimbingan Penelitian

LAKIP

lakip2011

Seminar Peternakan 2014

FlyerSeminarPeternakan-banner1

Integrated Biorefinary Seminar

isibio2014

You are here: Home Riset Riset 2009 PRODUKSI DAN KARAKTERISASI ENZIM REKOMBINAN XYLANASE DARI STRAIN LOKAL, TERMOFILIK Geobacillus stearothermophilus : BIOTROP 2009

Publikasi Bioteknologi

  • Laporan Teknik

  • Laporan Tahunan

  • Lakip Bioteknologi

  • BioTrends

  • Warta Biotek

  • Annales

  • Media Biotek

laporan-teknik-2010-coverSelama 3 tahun mendatang kegiatan prioritas yang diputuskan oleh LIPI ini diharapkan menghasilkan output yang Besar Signifikan dan Nyata (BSN) sesuai dengan target LIPI yang telah menjadi tekad bersama. Pada tahun ini penelitian padi telah menghasilkan output yang nyata yaitu dengan dilepasnya dua varietas padi gogo Inpago LIPI-Go1 dan Inpago LIPI-Go2. Diharapkan pada tahun mendatang kegiatan penelitian yang lain akan juga menghasilan output yang nyata.

Pelaksanaan kegiatan peternakan modern juga mulai dilaksanakan pada tahun 2011 dengan pembangunan gedung laboratorium baru dan sarana pendukung lainnya. Tersedianya sarana ini akan memfasilitasi kegiatan penelitian bioteknologi peternakan yang menjadi prioritas. Selain kegiatan prioritas, kegiatan tematik juga tetap dilakukan pada tahun 2011, beberapa kegiatan rintisan dan lainnya adalah kegiatan rutin yang dikelompokkan sebagai kegiatan kelembagaan. Untuk mendownloadnya Anda bisa mengklik alamat Laporan Teknik

laptahBuku Laporan Tahunan ini berisi hasil-hasil penelitian selama tahun 2011 yang dimaksudkan sebagai salah satu bentuk pertanggungjawaban Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI kepada masyarakat selaku Lembaga pemerintah non Kementrian (LPNK) yang bekerja menggunakan anggaran APBN. Laporan substansi penelitian ditampilkan sebagai rangkuman hasil dari setiap laboratorium selama tahun 2011.

Laporan kegiatan rutin administrasi juga disampaikan seperti tahun-tahun sebelumnya. Untuk mngunduh laporan tersebut secara lengkap Anda bisa mendownloadnya di Laporan Tahunan

lakipLaporan Akuntabilitas  Kinerja  lnstansi  Pernerintah  (LAKIP)  Pusat  Penelitian Bioteknologi,  Lernbaga  llrnu  Pengetahuan Indonesia (LIPI)  Tahun  2010  disusun untuk mernenuhi  lnstruksi  Presiden  (Inpres)  Nornor  7  Tahun  1999.  Seperti  pada tahun-tahun sebelurnnya, kernbali pada tahun 2010 ini Pusat Penelitian Bioteknologi- LIP1  rnelaksanakan  evaluasi  kinerja  dengan perangkat  AKlP  sesuai dengan keputusan  Kepala  Lernbaga Adrninistrasi  Negara  Nornor:  23911X/6/8/2003. Tahun 2010  ini merupakan  tahun pertama  RPJMN  2010-2014  dengan  sistern  anggaran DIPA.  Laporan  Akuntabilitas  Pusat  Penelitian  Bioteknologi  LIP1  ini  merupakan pencerminan  dari  seluruh  prograrnlkegiatan  yang  dilaksanakan  oleh  Puslit Bioteknologi  LIP1  pada  tahun  anggaran  2010,  yang  sebagian besar kegiatan penelitian yang dilakukan merupakan kegiatan peralihan atau  lanjutan dari RPJMN 2005-2009 dan program baru.

Unduh Lakip Bioteknologi

BIOTRENDSBioTrend. Majalah populer yang isinya menginformasikan perkembagan teknologi khususnya bidang bioteknologi baik berkaitan dengan hasil penelitian yang dilaksanakan oleh para peneliti di Puslit Bioteknologi LIPI, maupun perkembangan bioteknologi yang ada di luar Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI.

Majalah Biotrend ini di terbitkan oleh Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI sejak tahun 2005. Untuk informasi lebih lengkap Anda bisa memghubungi Sub Bagian Kerjasama dan Jasa, Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI, Jalan Raya Bogor KM 46, Cibinong 16911, telpon 021-8751527, 8754587, Fax.021-8754588. Untuk mengunduh majalah BioTrend dalam format PDF secara lengkap Anda bisa mendownloadnya di Majalah Biotrends

wartaMajalah Warta Biotek ini terbit sejak tahun 1986. Majalah ini menampung karya tulis staf peneliti Pusat Pebeitian Bioteknologi LIPI khususnya yang berkaitan dengan bidang bioteknologi. Warta Biotek ini saat ini sudah tidak terbit lagi, dan keberadaannya digantikan oleh majalah BioTrend. Isi maupun tujuannya juga sama, yaitu menampug karya tulis populer staf peneliti maupun non peneliti di Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI.

Karena Warta Biotek saat ini sudah tidak terbit lagi, apabila Anda memerlukan informasi atau karya tulis yang ada di majalah tersebut, Warta Biotek versi dijital bisa di akses melalui web atau bisa juga mendownlodnya di alamat Warta Biotek

annalesAnnales Bogorienses adalah jurnal ilmiah yang diterbitkan oleh Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI dan merupakakan satu-satunya jurnal berbahasa inggris yang dimiliki oleh Pusat Pebelitian Bioteknologi LIPI. Jurnal ini terbit enam bulanan serkali yang secara umum berisi tulisan tentang biologi dengan penekanan di bidang bioteknologi, biologi molekuler dan biokimia.

Annales Bogoriense yang diterbitkan oleh Pusat Penelitian Bioteknologi- Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI) sejak tahun 1992 (ISSN: 0517-8452). Untuk mengetahui dan memiliki terbitan Annasles Bogorienses dalam format PDF Anda dapat mendownloadnya di alamat Annales Bogoriense

media-biotekBerbeda dengan Warta Biotek yang isininya menampung karya tulis Staf Peneliti Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI, sedangkan Media Biotek merupakan media yang menginformasikan perkembangan baik yang berhubungan dengan penelitian, kunjungan, berita duka, dan lain-lain yang ada dilingkungan Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI.

Media biotek ini sudah terbit sejak tahun 2010. Memang beberapa waktu lalu Media Biotek ini sudah tidak terbit lagi, namun karena minat dan keinginan para Staff Peneliti di Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI untuk memiliki media informasi, maka Warna Biotek mulai tahun 2013 ini diterbitkan kembali. Untuk Media Biotek Anda bisa mendownloadnya di alamat ini Media Biotek

v-pills ankara escort bayan ankara escort escort bayan bayan escort eskort bayan bayan escort escort bayan bursa escort escort bursa